Cuando se proyectó la primitiva iglesia de la Compañia de Jesu, hacia 1571, se consideró también la existencia de dos capillas laterales. Producido el terremoto del 31 de marzo de 1650, en que cayó por el piso la iglesia principal, se vio por conveniente demoler las ruinas y construir un templo de mayor volumen, altura y belleza, con tres puertas sobre la plaza principal, la central y principal, al medio del imafronte de la imponente fábrica de la iglesia de la orden, mas de dos capillas laterales adosadas al monumento central, cada cual con su respectiva puerta sobre la plaza.